Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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H2-Ab1P01921 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-Ab1P01921 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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