Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01789 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01789 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01789 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms