Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P01747 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P01747 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P01747 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms