Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01660 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01660 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01660 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms