Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P01649 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P01649 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
P01649 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P01649 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms