Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops6O88545 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops6O88545 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops6O88545 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms