Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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