Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Foxq1O70220 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Foxq1O70220 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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