Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cldn5O54942 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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