Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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DffaO54786 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffaO54786 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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