Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pik3cdO35904 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pik3cdO35904 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms