Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sp100O35892 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms