Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptch2O35595 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ptch2O35595 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptch2O35595 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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