Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NmiO35309 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmiO35309 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmiO35309 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmiO35309 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmiO35309 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmiO35309 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms