Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms