Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CckarO08786 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CckarO08786 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CckarO08786 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CckarO08786 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms