Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcof1O08784 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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