Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MttpO08601 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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MttpO08601 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MttpO08601 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms