Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Speer4dL7N216 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Speer4dL7N216 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms