Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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