Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms