Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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