Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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