Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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