Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20830J3KML6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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