Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms