Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc1G3X9F6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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