Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Speer4aF8VPX6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms