Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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