Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms