Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm28048F7BCN0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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