Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms