Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod3E9QA62 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms