Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc1E9Q043 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms