Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd1E9PZ26 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms