Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54bE9PXC0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms