Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm3298E9PW80 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm3298E9PW80 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm3298E9PW80 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms