Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms