Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms