Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms