Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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