Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rrn3B2RS91 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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