Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms