Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp42B2RQC2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp42B2RQC2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp42B2RQC2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp42B2RQC2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp42B2RQC2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp42B2RQC2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms