Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trabd2bB1ATG9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms