Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms