Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms