Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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