Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SetxA2AKX3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms