Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ambra1A2AH22 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms